Le 1er juin 1943 elle s'engage, sous le nom de "Scarabée", dans la résistance à l'occupant allemand et rejoint le réseau de renseignements "Alliance" dirigé par Marie-Madeleine FOURCADE.

Le 16 mars 1944, recherchée par la Gestapo, elle est évacuée sur Londres (Angleterre).

En juillet 1944, pressée de reprendre le combat en France occupée et désirant participer au débarquement, elle s'engage comme ambulancière à la 2e D.B. (2e division blindée) et prend le nom de guerre de Micheline GARNIER.

Dans la journée du 13 août 1944, elle disparaît sur la route d'Argentan dans l'Orne et le soir même des témoins disent l'avoir aperçue prisonnière des Allemands.

Marie-Louise CHARBONNEL est ensuite vue prisonnière successivement à Strasbourg et à Ravensbrück.

Libérée par l'Armée rouge en 1945, elle n'est pas rapatriée.Plusieurs témoins se manifesteront ensuite pour dire l'avoir aperçue, ou avoir entendu parler d'elle, dans les camps soviétiques de : Potma, Norlisk, Magadan et Monino.